Label free,非標記定量技術,每個樣本單獨上機,無需要使用昂貴的同位素做內標,只需分析大規模鑒定蛋白質時產生的質譜信息,比較不同樣本中相應肽段的信號強度,從而對肽段對應的蛋白質進行相對定量。
直接根據一級質譜的峰面積進行蛋白定量,不需要同為素標記,實驗耗費低。對樣本的操作少,從而使其最接近原始狀態,所需樣本量低。
適用于蛋白差異明顯的樣本,如近源物種或同一物種的不同組織類型間的差異比較。可以進行有無蛋白差異分析。
每個樣本單獨上質譜檢測,需要足夠的技術重復以確保結果的可靠性,對液相色譜分離及串聯質譜鑒定的穩定性和重復性要求比較高。