常規的相對豐度分析忽略了不同樣本之間總體微生物量存在的現實差異,造成了分析結果的偏差。而絕對定量分析則是計量樣本每種微生物的16S基因拷貝數或者細胞數目,從而實現絕對定量,因此相對于常規16S相對定量擴增子測序,絕對定量分析能反映樣本每種微生物的真實數量和組間樣本的真實差異。
百邁客運用高通量測序技術和spike-in內標法實現對細菌的絕對定量。通過在樣品中加入已知拷貝數的spike-in內參序列,與樣品同時進行擴增、建庫測序,然后通過內參的理論拷貝數與測序tags數,繪制標準曲線,結合標準曲線及樣品的組織、核酸、擴增用量等計算得到OTUs/ASVs的絕對拷貝數表。能夠一次獲得所有細菌的絕對定量結果,包括總豐度和每種菌的豐度。
產品類型 | 支持區域 | 數據量 | 分析內容 |
---|---|---|---|
細菌絕對定量(三代) | 16S全長 | 1W CCS | 常規擴增子分析+絕對定量 |
細菌絕對定量(二代) | 16S V3-V4,16S V4 | 5W tags | 常規擴增子分析+絕對定量 |
組織類型 | 送樣量 |
---|---|
土壤 | 1~2g |
糞便 | 0.5~2g |
備注:上述組織送樣量均為三次提取的量